Для определения бактериального генома профессор Пэллен и его сотрудники применили «метод дробовика», суть которого – дробление генома на случайные фрагменты, затем секвенируемые обычными методами. Полученные перекрывающиеся нуклеотидные последовательности затем собирают с помощью специальных программ в единое целое. С помощью настольного секвенатора Illumina MiSeq ученые выявили ДНК туберкулезной бактерии во всех 8-ми исследуемых образцах мокроты и смогли определить штамм возбудителя в 7-ми из них. Процесс занял 1–2 дня.
Исследование было призвано принципиально подтвердить возможность использования метода для диагностики туберкулеза. Теперь группа Пэллена планирует продолжить изучение его возможностей на более широком спектре образцов.
Новый экспресс-тест избавит от антибиотиков при насморке
Исследователи из Университета штата Огайо (США) разработали экспресс-тест, позволяющий отоларингологу быстро и точно выяснить причину: аллергическую, вирусную или бактериальную, вызвавшую синусит, и избежать таким образом неоправданного назначения антибиотиков. Работа опубликована в журнале The Laryngoscope.Предыдущие исследования показали, что в придаточных пазухах носа пациентов с хроническим синуситом бактериальной природы чаще всего присутствуют бактерии, способные создавать биопленки. Эта форма существования позволяет микроорганизмам выжить при неблагоприятных факторах внешней среды. Так, они становятся устойчивыми к антибактериальным и дезинфицирующим средствам, к влиянию среды с различными значениями pH и даже к воздействию иммунной системы хозяина.
Авторы определили, что чаще всего в случае синусита речь идет о нетипируемом штамме бактерии Haemophilus influenzae (NTHI). Исследователям удалось выявить 2 внешних мембранных белка, выделяемых биопленкой NTHI, – OMP-P2 и OMP-P5, которые могут служить биомаркерами присутствия NTHI в пазухах носа. Идентификация биомаркеров в выделениях из носа проводится с помощью метода полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией. Тестирование метода на шиншилловой модели синусита показало его 100% чувствительность и специфичность в отношении 8-ми штаммов NTHI, приводящих к развитию бактериального синусита у человека.
«На приеме врач быстро берет мазок из носа и менее чем через 5 минут знает, входит ли пациент в число тех приблизительно 10% страдающих от синусита, кто действительно нуждается в антибиотиках, или нет, – обрисовал перспективу ведущий исследователь Субиной Дас. – Внедрение теста в клиническую практику позволит освободить от ненужного приема антибиотиков примерно 18 миллионов человек».
С. Дас уже нашел инвесторов и создал стартап-компанию ENTvantage, призванную вывести метод на рынок.
Швейцарцы нашли замену антибиотикам
Ученые из Бернского университета (Швейцария) создали универсальное средство для лечения бактериальных инфекций без использования антибиотиков, что может предотвратить развитие антибиотикоустойчивости. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Biotechnology.Хотя пенициллин используют в течение уже почти 90 лет, антибиотики по сей день остаются «золотым стандартом» в лечении бактериальных инфекций. Тем не менее ВОЗ неоднократно предупреждала о росте числа видов бактерий, устойчивых к действию антибиотиков.
Теперь ученые разработали наночастицы на основе липидов – так называемые «липосомы», которые по своему строению напоминают мембрану клетки-хозяина. Эти наночастицы действуют в качестве приманки для бактериальных токсинов и могут их нейтрализовывать. Без токсинов микроорганизмы оказываются беззащитны перед клетками иммунной системы организма и легко уничтожаются ими.
Благодаря лечению экспериментальными частицами мыши, у которых развился сепсис, выжили без дополнительной антибиотикотерапии. Теперь исследователи рассчитывают, что при помощи этих наночастиц удастся заместить антибиотики в лечении пациентов.
