Введение
Выявление взаимосвязи клинических особенностей фенотипа и подтвержденного молекулярно-генетическими методами генотипа позволяет не только уточнять дифференциальную диагностику заболевания, но и расширяет наши представления о клиническом течении заболевания и корректирует возможное лечение.Врожденная аниридия (OMIM #106210) (ВА) — моногенная наследственная патология, имеющая общемировую распространенность в популяциях по всему миру, по данным регистра редких и орфанных болезней Orphanet, 1:57 143 населения [1]. Ведущими диагностическими признаками являются врожденное отсутствие ткани радужки, гипоплазия фовеа, сопровождается нистагмом [2].
В большинстве случаев ВА встречается как изолированная патология: спорадическая или семейная с аутосомно-доминантным типом наследования (85%) и синдромальная (15%). Синдромальная ВА в 13% случаев выявляется в составе синдрома WAGR (OMIM #194072), в 2% случаев наблюдаются нетипичные формы ВА с рецессивным наследованием [2]. Синдром WAGR характеризуется 4 клиническими симптомами: опухолью Вильмса, аниридией, аномалиями мочеполовой системы и задержкой умственного развития [3].
В большинстве случаев ВА обусловлена гетерозиготными мутациями в гене PAX6 (OMIM*607108) [4], располагающемся на 11 хромосоме, в т. ч. хромосомными перестройками (регион 11p13) [5]. Синдром WAGR обусловлен делециями региона 11p13, захватывающими локусы гена PAX6 и гена предрасположенности к развитию опухоли Вильмса — WT1 (OMIM*607102).
Вариабельность клинической картины может быть очень высока. Кроме основных признаков при ВА могут развиваться: помутнения и/или сублюксация хрусталика разной степени, кератопатия (у 80% пациентов), реже встречаются глаукома и гипоплазия зрительного нерва. При ВА отмечается значительное снижение остроты зрения [6]. Таким образом, в 85% случаев изолированной ВА кроме радужки поражены другие структуры глаза. В 10% случаев при изолированной ВА пороки развития структур глаза могут сопровождаться поражениями центральной нервной, эндокринной, мочеполовой и других систем и органов, отличными от признаков синдрома WAGR [7].
В настоящее время не установлено конкретных взаимосвязей между типом мутации гена PAX6 или наличием и размером хромосомной делеции региона 11p13 и особенностями клинической картины ВА, в т. ч. ее тяжестью [8].
Целью данной работы является поиск возможных гено-фенотипических корреляций между клинической картиной заболевания и генотипом, определенным в ходе подтверждающей диагностики.
Материал и методы
Научным коллективом лаборатории генетической эпидемиологии ФГБНУ «МГНЦ» впервые в России ранее был проведен молекулярно-генетический анализ 110 пациентов из 84 неродственных семей с предположительным диагнозом «врожденная аниридия» [9].Подтверждающая и дифференциальная диагностика ВА проводилась в соответствии с протоколом, разработанным ранее в лаборатории генетической эпидемиологии ФГБНУ «МГНЦ» [10, 11]. От всех обследованных получено информированное согласие на обработку персональных данных и клинико-лабораторное обследование, исследование одобрено этическим комитетом ФГБНУ «МГНЦ».
Критериями включения пациентов в настоящий анализ гено-фенотипических корреляций были:
клинический диагноз ВА;
установленная молекулярная причина заболевания;
молекулярная причина ВА не является делецией WAGR-области, что может быть связано с ранним выявлением синдрома WAGR, который у данных пациентов еще не развился ввиду малого возраста (<1 года);
наличие данных детального офтальмологического осмотра.
Согласно данным критериям, из дальнейшего анализа были исключены: 3 пациента без мутаций гена PAX6 или делеций хромосомной области 11р13; 3 больных без подробного описания клинической картины; 6 пациентов, у которых обнаружена делеция хромосомной области, критичной для развития WAGR синдрома.
Таким образом, в настоящий анализ гено-фенотипических корреляций включены 98 пациентов с ВА из 73 неродственных семей (44 спорадических случая и 54 семейных). Средний возраст — 16,9±16,8 года (варьирует от 6 мес. до 65 лет); большинство больных в выборке (66 человек, 67,3%) обследованы в возрасте до 12 лет. Соотношение по полу (мужчины : женщины) составляет 1:1,3. Клинический диагноз установлен в результате осмотра пациентов в ФГБНУ «МГНЦ» (52 пациента) и в Чебоксарском филиале ФГАУ «МНТК «Микрохирургия глаза» им. акад. С. Н. Федорова» (46 пациентов).
Среди данных пациентов ранее в результате секвенирования экзонов и фланкирующих участков интронов гена PAX6 мутации были определены у 74 человек (75,5%). Основную часть составляют мутации сдвига открытой рамки считывания и нонсенс-мутации, в сумме дающие 2/3 всех выявленных внутригенных мутаций.
У 24 пациентов (24,5%) методом MLPA определены различные делеции региона 11p13 [9].
Далее были сформированы группы пациентов со схожими по молекулярным последствиям генотипами, у которых анализировался фенотип по ключевым для ВА признакам.
Статистический анализ проведен с использованием точного критерия Фишера.
Результаты и обсуждение
Генетические причины ВА разделены на 6 групп: 4 группы малых мутаций гена PAX6: нонсенс-мутации (n=29 пациентов), миссенс-мутации (n=6), мутации сайтов сплайсинга и интронные варианты (n=14), нарушающие сплайсинг, небольшие инсерции и/или делеции, приводящие к сдвигу открытой рамки считывания (n=19), 2 группы крупных хромосомных перестроек: затрагивающие регион 11p13 без учета делеций 3′-цис-регуляторной области гена PAX6 (n=11) и хромосомные делеции региона 11p13, затрагивающие только 3′ цис-регуляторную область (n=13) (табл. 1).Выделено 6 характерных клинических признаков ВА: наличие полной или частичной аниридии, нистагма, кератопатии 1—3 стадии, катаракты (без разделения на врожденную и осложненную), глаукомы (также без разделения на врожденную и осложненную) и гипоплазии центральной ямки сетчатки.
Для поиска взаимосвязи между характерными фенотипическими признаками, часто встречающимися у пациентов с ВА, и обнаруженными типами мутаций были построены таблицы сопряженности 2Х2, которые проанализированы с помощью точного критерия Фишера (табл. 2).
В результате анализа выявлено несколько закономерностей. При нонсенс-мутациях достоверно чаще наблюдаются полное отсутствие ткани радужки и развитие кератопатии (p=0,002923 и p=0,040567 соответственно).
У пациентов с мутациями сдвига открытой рамки считывания достоверно чаще развиваются катаракта и глаукома (p=0,035935 и p=0,02488 соответственно).
Частичная аниридия встречается при миссенс-мутациях достоверно чаще (p=0,021778), чем при остальных типах мутаций.
Более мягкий фенотип достоверно чаще наблюдается у пациентов с делециями 3′-цис-регуляторной области гена PAX6. Для него характерно отсутствие нистагма, глаукомы, кератопатии, гипоплазии фовеа (p=0,040246, p=0,000418, p=0,007655, p=0,00074 соответственно).
Фенотипы пациентов с хромосомными делециями, исключая делеции 3′-цис-регуляторной области, не отличаются от фенотипов пациентов в общей выборке и не выделяются в отдельную группу (p>0,1).
В 1998 г. S. K. Gupta et al., опираясь на мнение Т. Glaiser et al. о возможности разной степени повреждения функций PAX6 и деления патогенных аллелей на 3 класса: аморфные, гипоморфные или неоморфные, предположили и впервые проанализировали существование гено-фенотипических корреляций при ВА [12, 13]. Допуская разные роли изоформ белка, содержащих разные домены, S. K. Gupta et al. предположили, что некоторые клинические признаки ВА вызваны повреждением разных доменов белка PAX6. По их мнению, катаракта чаще ассоциирована с мутациями, разрушающими PST домен, а развитие повреждений сетчатки — с мутациями в парном домене. Однако высказанная теория не была подтверждена статистически достоверными методами, что, вероятно, связано с небольшой рассматриваемой выборкой пациентов с ВА (n=11).
Наши результаты частично согласуются с процитированными выше авторами [8, 12, 13]. Теория Т. Glaiser et al. о трех разных типах мутантных аллелей PAX6, т. е. о разных последствиях разного типа мутаций и исходно разном индивидуальном уровне экспрессии PAX6 под влиянием генетического фона, превосходно объясняет клиническую гетерогенность ВА, выявленную и в нашем исследовании [12]. I. Tzulaki et al., не находя никаких статистически значимых корреляций фенотипа от генотипа, объясняют сглаживание различий в последствиях нонсенс-мутаций и мутаций сдвига открытой рамки считывания разной локализации существованием универсального механизма деградации мРНК с преждевременным стоп-кодоном (NMD), независимо от того, где локализована мутация, приводящая к возникновению PTS [8]. Однако и S. K. Gupta et al. отчасти оказались правы в том, что локализация мутации может влиять на тип повреждения функции PAX6.
Для проверки гипотезы S. K. Gupta et al. проведен дополнительный анализ, для которого идентифицированные в нашем исследовании мутации разделены на 6 групп по принципу их локализации. Проанализирована возможная зависимость каждого из 6 характерных клинических признаков ВА от локализации мутаций в разных доменах белка PAX6 (табл. 3).
Данный анализ показал, что, в отличие от данных S. K. Gupta et al. [12], с гипоплазией фовеа достоверно чаще ассоциированы только мутации в линкерной области и гомеодомене (p=0,016921). Достоверная зависимость получена также для признака развития катаракты и небольшой группы мутаций в 5′-UTR и изменений старт-кодона.
В нашей работе мы разделили мутации не по принципу их локализации в определенных доменах белка PAX6, а по категориям, предположительно отражающим типы повреждения функции. Таким образом, мы в полной мере следовали принципу теории Т. Glaiser et al. о соответствии клинической картины типу мутантного аллеля: в разной степени гипоморфного или полностью аморфного [13]. Гипоморфные аллели, по всей видимости, продуцируются миссенс-мутациями и делециями 3′ цис-регуляторной области гена PAX6, не затрагивающими его кодирующую последовательность. Им соответствуют более мягкие фенотипы. Аморфные аллели с полной потерей функции продуцируются нонсенс-мутациями и мутациями, приводящими к сдвигу открытой рамки считывания, особенно если эти мутации повреждают N-конец белка (парный и гомеодомены), а также хромосомными делециями 11р13, захватывающими кодирующую последовательность гена PAX6.
Заключение
В связи с высокой генетической гетерогенностью и клиническим полиморфизмом до сих пор не были установлены гено-фенотипические корреляции при ВА. В первую очередь это связано с необходимостью достаточного количества больных в анализируемой выборке и наличием подробного описания клинической картины ВА у этих пациентов. Использование выборки из 98 пациентов позволило изучить и впервые выявить гено-фенотипические корреляции в группе пациентов с ВА. Проанализированы возможные взаимосвязи между каждым из 6 видов мутаций в гене PAX6 (нонсенс, сдвига открытой рамки считывания, миссенс, сплайсинга или делециями 11р13, захватывающими только регуляторный регион или кодирующую последовательность гена PAX6) и каждым из основных характерных фенотипических признаков ВА.В результате исследования впервые установлены следующие закономерности. При нонсенс-мутациях достоверно чаще наблюдаются полное отсутствие ткани радужки и развитие кератопатии, при мутациях сдвига открытой рамки считывания достоверно чаще развиваются катаракта и глаукома, таким образом, фенотипы, ассоциированные с мутациями, приводящими к потере функции, характеризуются более тяжелым клиническим течением, что, возможно, обусловлено значительным повреждением функции гена из-за полной потери одного аллеля. Несинонимичные замены ассоциированы с таким же, как и в общей выборке, фенотипом ВА, однако частичная аниридия встречается при миссенс-мутациях достоверно чаще, чем при остальных типах мутаций. Фенотипы пациентов с хромосомными делециями, исключая делеции 3′ цис-регуляторной области, не отличаются от фенотипов пациентов с внутригенными PAX6 мутациями. Более мягкий фенотип сразу по нескольким клиническим признакам наблюдается у пациентов с делециями
3′ цис-регуляторной области гена PAX6.
Выявление особенностей клинического течения ВА в зависимости от обнаруженных мутаций представляет не только клинический, но и значительный научный интерес, т. к. свидетельствует об одном из реально функционирующих в организме человека механизмов регуляции функции гена PAX6.