Ученые из Китая создали регуляторную сеть микроРНК и мРНК, чтобы выявить гены, ассоциированные с расслоением аорты (РА). Авторы нового исследования установили, что в развитии РА играют роль онкоген CBL и его регуляция через фактор транскрипции HOXB13 и microRNA-1321 (miR-1321).

Чтобы найти потенциальные биомаркеры расслоения аорты, ученые провели анализ дифференциальной экспрессии генов (DEG). Анализ включал 1471 ген с измененной экспрессией на фоне AD:, у 1366 из которых экспрессия была повышена, у 105 — понижена. Анализ обогащения по функциональной принадлежности (GSEA) выявил 10 путей, включающих 727 генов. Три пути были тесно связаны с AD: путь JAK-STAT, путь трансформирующего фактора роста-β (TGF-β) и путь сосудистого эндотелиального фактора роста (VEGF).

Ученые также провели анализ микроРНК, экспрессия которых изменилась и которые, следовательно, могут участвовать в посттранскрипционной регуляции генов, вовлеченных в развитие AD. Всего было обнаружено 43 дифференциально экспрессируемых микроРНК, из которых 26 имели повышенную экспрессию и 17 — пониженную.

Затем изучили взаимосвязи между дифференциально экспрессируемыми мРНК и микроРНК. Для шести мРНК и семи микроРНК связи были статистически значимыми. Среди них внимание исследователей привлекла miR-1321, мишенью которой были три мРНК (CBL, рецептор интерлейкина 2 гамма, IL2RG; и фосфолипаза A2 группы IIA, PLA2G2A). Остальные микроРНК таргетировали по одной мРНК.

Таким образом, анализ дифференциальной экспрессии и исследование in vitro образцов аорты говорят о том, что в развитии диссекции аорты играют роль CBL, который может регулироваться на уровне транскрипции HOXB13 и посттранскрипционно — с помощью miR-1321. Авторы считают CBL и его регуляторы перспективными потенциальными биомаркерами для ранней диагностики расслоения аорты. Примечательно, что HOXB13 и микроРНК-1321 можно измерить в сыворотке крови или циркулирующих клетках.

Источник: https://www.scienceopen.com/hosted-document?doi=10.15212/CVIA.2024.0034